Ce moulin a été construit au XVIème siècle près du site archéologique gallo-romain de Trouguer sur la commune de Cléden-Cap-Sizun.
La commune possédait à l'époque seize moulins, le moulin de Trouguer (en fait les moulins) est le dernier, il a probablement fonctionné jusque la fin des années 1940.
Racheté par la commune fin des années 1990, il a été entièrement renové en 2003-2006.
Moulin tour en granit, il est accompagné d'un plus petit moulin de type "chandelier" ou kandelou dans sa version bretonne. Là, c'est l'ensemble du moulin qui pivote sur son socle en pierres.
Des visites et des moutures sont organisées ainsi que la vente de farine de blé noir notamment.
Tous les premiers dimanches d'août, se tient la fête de la moisson.
Avec présentation des techniques anciennes, défilé en costumes traditionnels, jeux bretons...